Елена Яковлевна Данько родилась в селе Парафиевка Черниговской губернии в семье железнодорожных служащих.

Художественное образование получила в школе живописи Александра Мурашко в  Киеве и в студиях  Ильи Машкова и Фёдора Рерберга в  Москве. В 1924—1925 годах училась в Академии художеств в Петрограде.

С 1916 по 1924 год работала на Петроградском (Ленинградском) фарфоровом заводе художницей по росписи фарфора, а с 1924 года кукловодом и сценаристом кукольного театра. С 1923 года состояла членом литературной коллегии «Театра юных зрителей».

С 1922 года изучала историю керамики. В 1923 году журнал «Художественный труд» напечатал её статью о советском художественном фарфоре. Позднее она написала ряд книг по истории фарфора. Елена Данько была также историографом Ленинградского фарфорового завода.

В 1931 году она написала повесть «Деревянные актёры» — о куклах-марионетках и бродячих кукольниках Италии, Германии, Франции во второй половине XVIII-го века.

В 1941 году вышло самое известное произведение Данько — сказочная повесть «Побеждённый Карабас», являющаяся продолжением сказки «Золотой ключик, или Приключения Буратино» Алексея Толстого. В ней герои попадают в довоенный Ленинград. Книга с тех пор неоднократно переиздавалась.

Умерла от последствий истощения при эвакуации из блокадного Ленинграда в 1942 году.