Родился 23 июля 1917 года в деревне Калиновка Жовтневого района Николаевской области Украины в семье крестьянина. Украинец. Окончил два курса вечернего рабфака. Работал разметчиком на Николаевском кораблестроительном заводе. В Советской Армии — с 1938 года. Окончил Одесскую военную авиационную школу, участвовал в советско-финляндской войне 1939—1940 годов.
В Великую Отечественную войну командовал звеном 434-го истребительного авиационного полка 16-й воздушной армии. Старший лейтенант А. Я. Баклан к октябрю 1942 года совершил 400 боевых вылетов, сбил лично 13 самолетов противника и 23 — в группе.
Звание Героя Советского Союза ему присвоено 23 ноября 1942 года. Награжден он двумя орденами Ленина, орденами Красного Знамени, Суворова III степени, Отечественной войны I степени, Красной Звезды, медалями.
После войны командовал эскадрильей, авиационным полком. В 1952 году окончил Военно-воздушную академию. С 1957 года был на преподавательской работе. С 1963 года полковник А. Я. Баклан — в отставке. Жил в Пскове, работал в областном управлении связи. Умер А. Я. Баклан 20 мая 1985 года. Похоронен в Пскове.
Литература:
Баклан Андрей Яковлевич // Корнеев Н. П., Алексеев О. В. Подвиги героев бессмертны. – Псков, 2005. – С. 208-209.